Triofox varmistaa jaettujen kansioiden turvallisuuden tarjoamalla kaksisuuntaisen synkronoinnin salauksella, sekä levossa että siirron aikana oleville tiedoille. Se käyttää tiedon osoitesalausta siirtojen yhteydessä ja salaa laitteiden paikallisen välimuistin sekä S3:ssa tallennetut tiedot, ylläpitääkseen HIPAA-vaatimusten mukaisuutta ja turvatakseen tietosi.