Versionhallinta Triofoxissa tarkoittaa, että aina kun käyttäjä tallentaa tai lataa tiedoston, luodaan tiedostosta täydellinen kopio repositorioon. Tämä ominaisuus, joka voidaan ottaa käyttöön tiedostoversioiden säilytysajan määrittämiseksi, tarjoaa vankat versionhallinta- ja palautusvaihtoehdot, varmistaen tietojen eheyden ja vaatimustenmukaisuuden sääntelynormien kanssa.